בכל הנוגע לתרחישי יישומים, בחירת מערכת קירור השרת תלויה בתצורה ובסביבת ההפעלה הספציפית של השרת. לדוגמה, מערכות קירור נוזלי עשויות להתאים יותר למדפי שרתים בצפיפות- גבוהה, שבהם המקום מוגבל והחום מרוכז; לעומת זאת, מערכות קירור אוויר מספיקות עבור סביבות משרדיות כלליות או מרכזי נתונים קטנים. בנוסף, יש לקחת בחשבון גורמים כמו צריכת חשמל, רמות רעש ועלויות תחזוקה בעת בחירת פתרון קירור.
